從超級電容器在近些年媒體的大力宣傳，市場的應用普及上，超級電容器近乎一夜之間就被人強制性的搬上了神壇，超級電容器的缺點其實也是有的，只是并沒有太多的文章去進行舉例出來。

超級電容器的缺點最明顯的就是耐壓的一個問題了，在一個耐壓性能上就對超級電容器的一個使用環境的限制很多，雖然可以通過進行模組的方式來提升耐壓值但是在本體尺寸上也是變大，成本也是會提高，所以在一個使用場景并不算廣泛，所以有些文章指出了目前國內較多的企業使用技術還不能高效的使用超級電容器，其實就是一些電壓性的問題需要生產企業去進行調整來使用，算的上是要使用設備來遷就元器件的概念，這個算的上超級電容器一個較大的缺點了。

超級電容器的快速充放電算是一個雙刃劍，它既有很明顯的優點，也存在缺點，雖然超級電容器是大存儲，又能快速充放電，如果在某些特定的情況下，斷電后可以進行供電運行一定的時間，如果是大電量使用的情況下，可以說的上是直接就把能源釋放完了，像經常被詬病的行車記錄儀，想把設備拿下汽車進行觀看，直接就沒電了，這也是較為明顯的一種缺點。

本文指出了目前超級電容器在性能兩項較為明顯的缺點，不過總體來說超級電容器不算是新鮮事物，十幾年前就已經有超級電容器運用，當時并沒有多少使用率，發展緩慢，隨著近幾年的大力推廣發展，技術也是越來越新穎，這些技術性的問題，隨著技術的攻破研發，克服也是時間上的問題。